屋頂電站的設計相對較為復雜，受屋頂大小、布局、材質承重、以及陰影遮擋等影響，需要通過組件鋪設和逆變器選型規劃來實現收益最大化。

同時組件安裝在屋頂，需要考慮火災防范等安全問題。接入配電網，直接靠近用戶負荷，需要考慮用戶用電安全性，電能質量符合要求，及與原有配電之間的繼電保護協調等。接入用戶配電網后，對用戶的功率因數影響十分明顯，逆變器除了輸出有功外，還需要快速的根據光伏系統實時發電情況、用戶實時負荷數據以及用戶配電房原有的SVC、SVG投入情況綜合計算以確定逆變器的實時無功輸出容量。

因此，屋頂光伏系統方案的選用需要在安全、電網友好、投資回報、維護等多個因素中尋求平衡點。

屋頂結構復雜，為了簡化設計，推薦使用組串型逆變器，并且根據實際屋頂和并網點的位置及并網點電壓等級，選擇逆變器。組串型逆變器需要具備拉弧監測和關斷能力，以有效防止火災的發生，具備PID消除功能，具備高精度漏電流保護功能和孤島保護功能等。

大型廠房，考慮到屋頂承重和維護便利性，可選用集中型方案。工業廠房屋頂平坦、規模大、陰影遮擋少、朝向簡單、多為10kV中壓配電網并網。考慮到大多廠房為彩鋼屋頂，承重有限無法安裝組串型逆變器，以及日常維護便利、不影響正常生產運行等實際情況，可選用集中型逆變器。